Västsvenska paketets totala budget är 34 miljarder kronor i 2009 års prisnivå. Parterna jobbar aktivt med styrning och uppföljning av projekten. Varje projekt ska pröva alla möjligheter att hantera eventuella kostnadsökningar inom projektets budget genom exempelvis omprioriteringar. Om en kostnadsförändring konstateras inom något projekt kan diskussion föras om exempelvis omfördelning mellan projekt inom Västsvenska paketet.
Västsvenska paketets Ledningsgrupp har, inom Västsvenska paketets totala budget, mandat att besluta om bland annat kostnadsförändringar upp till sammanlagt 150 miljoner kronor per kalenderår. Kostnadsförändringar överstigande detta beslutas av respektive parts beslutande organ. För beslut inom Västsvenska paketet krävs att samtliga parter är eniga.
Sedan 2019 har parterna enats om en gemensam hållning, vilken innebär att kommande projekt avtalas med ett fast belopp från Västsvenska paketet.